Theo đó, các hạng mục được tu bổ bao gồm: tổng thể sân vườn, tam quan, gác chuông, tam bảo, nhà trung, phủ thờ, cổng phụ, nhà bia, hành lang, hậu đường với tổng kinh phí đầu tư 17,7 tỷ đồng. 

Các nội dung tu bổ đều dựa trên cơ sở nguyên mẫu, giữ nguyên cấu trúc tổng thể công trình, thay thế các cấu kiện bị hư hỏng bằng vôi vữa truyền thống và gỗ lim chất lượng… 

Trong quá trình triển khai dự án, đơn vị chủ đầu tư, đơn vị thi công, tư vấn giám sát, chính quyền, nhân dân địa phương và trụ trì chùa Bút Tháp phối hợp chặt chẽ nhằm bảo đảm đúng tiến độ, mỹ thuật công trình. 

Chùa Bút Tháp có tên chữ là Ninh Phúc Thiền Tự, được khởi dựng thời Trần Thánh Tông (1258 - 1278). Chùa Bút Tháp có kiến trúc tổng thể rất độc đáo, bố cục gọn gàng, cân xứng, chặt chẽ và sinh động, kiến trúc của chùa theo kiểu nội công ngoại quốc. 

Năm 2013, chùa Bút Tháp đã được Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch và UBND tỉnh Bắc Ninh đầu tư trên 43 tỷ đồng để trùng tu tôn tạo các hạng mục của chùa. Với các giá trị đặc biệt về lịch sử - văn hóa nghệ thuật kiến trúc, nghệ thuật điêu khắc, chùa Bút Tháp đã được Chính phủ xếp hạng di tích quốc gia đặc biệt.